atlas:ATLAS-开始分析您的基因组数据的三个命令

时间:2024-05-22 13:12:06
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更新时间:2024-05-22 13:12:06

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元基因组图谱 Metagenome-atlas是一种基于蛇形设计的易于使用的宏基因组学管道。 它处理从质量控制,装配,装箱到注释的所有步骤。 您可以通过三个命令开始使用图集: conda install -y -c bioconda -c conda-forge metagenome-atlas atlas init --db-dir databases path/to/fastq/files atlas run all 网页 文献资料 引文 ATLAS:Snakemake工作流程,用于集合,注释和元基因组序列数据的基因组合并。 Kieser,S.,Brown,J.,Zdobnov,EM,Trajkovski,M.&McCue,LA BMC Bioinformatics 21,257(2020)。 doi: 发展/扩展 这是我有时间或工作时想做的一些想法。 如


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