obonet:OBO格式的本体→networkx(Python 3)

时间:2021-05-01 21:40:35
【文件属性】:
文件名称:obonet:OBO格式的本体→networkx(Python 3)
文件大小:23KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-01 21:40:35
python parser network ontology networkx obonet:将OBO格式的本体加载到networkx中 阅读Python中的OBO格式的本体。 obonet是 方便使用的 废话 pythonic 现代的 简单且经过测试 轻的 利用 这个Python 3.4+软件包将OBO序列化的本体加载到网络中。 函数obonet.read_obo()接收一个.obo文件,并返回该本体的表示形式。 该解析器是为OBO规范版本和。 用法 该软件包是在python≥3.4上设计和测试的。 可以从路径,URL或打开的文件句柄读取OBO文件。 压缩是从路径的扩展名推断出来的。 请参阅下面的示例用法: import networkx import obonet # Read the taxrank ontology url = 'https://github.com/dhimmel/obonet/raw/main/tests/data/taxra
【文件预览】:
obonet-main
----pyproject.toml(197B)
----.github()
--------workflows()
----tests()
--------data()
--------test_obo_reading.py(5KB)
----obonet()
--------io.py(2KB)
--------read.py(7KB)
--------__init__.py(376B)
----setup.cfg(2KB)
----examples()
--------go-obonet.ipynb(14KB)
----setup.py(38B)
----LICENSE.md(3KB)
----.gitignore(262B)
----README.md(4KB)
----.pre-commit-config.yaml(730B)

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