文件名称：PADDLE:使用PADDLE预测转录因子激活结构域区域
文件大小：8.37MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-25 08:52:45
JupyterNotebook
桨 （在真核生物中使用深度学习的激活域的预测因子） PADDLE是从蛋白质序列预测转录因子激活结构域区域的工具。 PADDLE是一个深度卷积神经网络，经过酵母中的高通量激活测定数据训练，可以准确预测激活域的位置和强度。 已通过实验验证可预测人类细胞中人类蛋白质区域的激活。 参见 有关更多详细信息，请 。 这里包括： PADDLE模型文件，用于使用TensorFlow加载（模型/） 用于输入PADDLE的Arg81酵母转录因子的序列和预测的二级结构（数据/） 使用PADDLE运行预测的函数（paddle.py） Jupyter笔记本显示了有关野生型和突变蛋白序列（PADDLE_predictions.ipynb）的示例预测 对跨物种的所有核蛋白的PADDLE预测也已预先计算，可在。 由开发（联系方式： ）。