文件名称：BLAST:BLAST算法
文件大小：112KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-05 23:06:36
C
序列对齐 C 中的 Smith-Waterman 和 Needleman-Wunsch 对齐 关于 最佳局部（Smith-Waterman）和全局（Needleman-Wunsch）对齐算法的C实现。 编写快速，便携且易于使用。 命令行实用程序smith_waterman和needleman_wunsch提供了极大的灵活性。 代码也可以很容易地包含在第三方程序中，有关示例，请参见nw_example/和sw_example/目录。 还包括 perl 模块，为程序提供 perl API。 特征： 对齐任何一对 ASCII 序列（DNA、蛋白质、单词等） 指定比对评分系统或选择一个通用评分系统（BLOSUM 等） 指定与给定分数匹配任何字符的通配符 对齐--nomismatches匹配 ( --nomismatches )，或无间隙 ( --nogaps ) 与局部和全局对齐。 当两者