论文研究-融合PPI网络和基因表达的复合物识别算法.pdf

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文件名称：论文研究-融合PPI网络和基因表达的复合物识别算法.pdf
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更新时间：2022-10-10 12:03:17
论文研究 论文研究-融合PPI网络和基因表达的复合物识别算法.pdf,  从大规模相互作用网络中识别蛋白质复合物，对解释特定的生物进程和预测蛋白质功能具有重要作用，同时也是后基因组时代一 个最重要的研究课题. 考虑到传统仅基于蛋白质相互作用网络（PPI网络）的蛋白质复合物识别算法可靠性不高，本文提出 了一种新的融合PPI网络和基因表达数据的蛋白质复合物识别算法IPCIPG. 区别于之前用基因表达数据评估PPI网络可靠性的做法，本文提出在蛋白质复合物的识别过程中将PPI网络和基因表达数据有机地结合起来. 算法IPCIPG首先根据边聚集系数（ECC）与蛋 白质间共表达的相关性（PCC）计算PPI网络中每个节点的权重，权重最大的节点作为种子，然后从种子节点开始扩充生成稠密子图. 基于酵母数据集的实验结果表明，算法IPCIPG较其他算法HUNTER，HC-PIN，CMC，SPICI，MOCDE，MCL能够更准确，更有效地 识别出具有特定生物意义的蛋白质复合物.