文件名称：matlab匹配滤波代码-Adaptive-Concentration-Threshold:自适应浓度阈值
文件大小：11.86MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-12 19:58:54
系统开源
matlab匹配滤波代码自适应浓度阈值 一般信息 •该存储库代码用于手稿中的数据分析，图表和统计：“由Sagi Levy和Cori Bargmann编写的气味和动物导航的自适应阈值机制”，已在Neuron上发表。 任何附带的代码或数据的使用都应引用此手稿。 •所有代码都是用Matlab（MathWorks）编写的，每个功能都提供了详细的注释和说明。 如下所述，代码被安排在五个库中。 •原始数据存储库：大多数原始数据存储在小型的'.mat'文件中，并且在此存储库中可用。 可以从Mendeley Data下载所有数据，包括大尺寸的原始数据和已处理的数据。•将输入的原始数据文件加载到函数中。 请确保文件存在于相关目录或Matlab路径中。 或者，请在函数中更新正确的文件路径。 代码组织和说明 资料库1：固定在微流控设备中的动物中AWC（ON）钙活性的成像，与图1、2、5，S1-S3和S5相关 •基本图像处理：在固定蠕虫的不同AWCON隔室中提取原始荧光。 按照上面显示的顺序运行功能：•ImmobilizedWorm_SomaTracker.m•ImmobilizedWorm_ProcessT
【文件预览】：
Adaptive-Concentration-Threshold-master
----Library3_MultiWormBehaviorTracker()
--------Information_Exp1.m(2KB)
--------Information_Exp2.m(3KB)
--------FragmentTracker_SL_ScreeningSetup_v10.m(90KB)
--------SegmentationSettings_HighThroughputDevice_v02.m(9KB)
--------SegmentBehavior_SingleTrack_HighThroughputDevice_02.m(113KB)
--------MatFiles()
--------SegmentBehavior_HighThroughputDevice_02.m(41KB)
--------PlotsAndStats_Figs_4D_4E.m(12KB)
--------ProcessData_Figs_4D_4E.m(15KB)
--------AnalyzeMorphologyProperties_HighThroughputDevice_02.m(4KB)
--------MultiWormTracker_HighThroughputDevices_SL.m(111KB)
--------StitchFiles_MultipleSessions_v02.m(17KB)
--------CorrectFlowDelaysForPulseDevices_02.m(23KB)
--------FragmentTrackDye_02.m(20KB)
--------AnalyzeLocomotionProperties_SL_HighThroughputDevice_02.m(40KB)
----Library5_ZebrafishOT()
--------MatFiles()
--------PlotsAndStats_ZebrafishOT_LoomingResponse_Fig7.m(31KB)
--------ProcessZebrafishOT_LoomingResponse_Fig7.m(28KB)
----Library2_ImagingFreeMovingWorms()
--------AnalyzeLocomotionProperties_ImagingSetup_v2.m(41KB)
--------StitchTracks_ExtractNeuronPosition_02.m(183KB)
--------AnalyzeMorphologyProperties_ImagingSetup_v3.m(3KB)
--------SegmentationSettings_ImagingSetup_v02.m(9KB)
--------CalculateActivityAndStimulusFeatures_04.m(36KB)
--------AnimalAndNeuronTrackerGUI_02.m(83KB)
--------MatFiles()
--------ExtractNeuralActivityFromTracks_AfterGUI_02.m(7KB)
--------Tracker_NeuronalImagingGradientDevice.m(89KB)
--------SegmentBehavior_ImagingInGradient_v03.m(40KB)
--------FragmentTracker_SL_ImagingSetup_v09.m(110KB)
--------SegmentBehavior_SingleTrack_ImagingSetup_v3.m(115KB)
--------PlotsAndStats_Figs_3_4.m(120KB)
--------StitchAndProcessGradientImagingExperiments_v02.m(61KB)
----README.docx(29KB)
----LICENSE(131B)
----README.md(14KB)
----Library1_ImmobilizedWorms()
--------ImmobilizedWorm_DyeTracker.m(6KB)
--------PlotsAndStats_Figs_1_2_5.m(178KB)
--------ImmobilizedWorm_ProcessTracker.m(14KB)
--------ProcessData_Figs_1_2_5.m(236KB)
--------ImmobilizedWorm_SomaTracker.m(11KB)
--------MatFiles()
----Library4_NoiseFilteringAnalysis()
--------PlotNoiseFilteringAnalysis_Fig6.m(31KB)
--------NoiseFilteringAnalysis_Fig6.m(58KB)