文件名称：matlab加权pca代码-WSPCA:加权稀疏PCA
文件大小：19.13MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-17 01:38:31
系统开源
Matlab推荐世界体育运动会 加权稀疏PCA 该github存储库包含所有支持加权稀疏PCA手稿的matlab和R代码和函数。 还包括（派生的）数据和结果。 该存储库包含一个用于所有matlab代码的MATLAB分支，一个用于所有R代码的R分支，一个具有从公共数据派生的数据的DATA分支以及一个RESULTS分支，其结果包含在模拟数据和经验数据上获得的结果。 1.创建数据 -基因表达数据：运行R脚本R / SCRIPT_ProcessingGSE29614_2007.R和R / SCRIPT_ProcessingGSE29617_2008.R 。 这将从在线数据库中检索表达数据，并创建两个季节的RMA预处理表达矩阵。 所得的经过预处理的基因表达数据存储在DATA / GSE29614_rma.txt （2008季节）和DATA / GSE29617_rma.txt （2007季节）中。 此外，还会创建带有受试者ID和疫苗接种后天数的表型数据（ DATA / GSE29614_pdata.txt和DATA / GSE29617_pdata.txt ），以及包含由GESTr软件包产生的两
【文件预览】：
WSPCA-master
----RESULTS()
--------boxplot_Prandom_sparse0.5_congruenceP_I100_J100.pdf(8KB)
--------boxplot_Prandom_sparse0.5_congruenceP_I1000_J100.pdf(8KB)
--------boxplot_Prandom_sparse0.5_pressP_I1000_J100.pdf(8KB)
--------boxplot_Prandom_sparse0.5_congruenceP_I1000_J1000.pdf(8KB)
--------boxplot_Prandom_sparse0.5_pressP_I100_J1000.pdf(8KB)
--------boxplot_Prandom_sparse0.5_pressP_I100_J100.pdf(8KB)
--------boxplot_Prandom_sparse0.5_pressP_I1000_J1000.pdf(8KB)
--------readme(23B)
--------boxplot_Prandom_sparse0.5_congruenceP_I100_J1000.pdf(8KB)
----MATLAB()
--------WSPCAnoupdateP.m(4KB)
--------pstrLoss.m(197B)
--------Scipt_Preprocessing_2007.m(2KB)
--------pstr.m(2KB)
--------ystar.m(238B)
--------revision_GenerateDatavPunif.m(7KB)
--------Update_scale.m(830B)
--------analysis_simulateddata_withrotation.m(4KB)
--------Update_offset.m(556B)
--------reflexmat.m(241B)
--------WSPCA.m(5KB)
--------WSPCALOSS.m(439B)
--------Update_scores.m(1KB)
--------Update_loadingsCardinalityV2.m(1KB)
--------Scipt_Preprocessing_2008.m(2KB)
--------WSPCAcardinality_overpcs.m(4KB)
--------subsamplingWSPCAcard.m(1KB)
--------Update_loadings.m(3KB)
--------readme(422B)
--------residual.m(319B)
--------script_AnalysisInfluenzaData.m(12KB)
--------revision_analysis_simulateddata_Punif.m(5KB)
--------tuckercongruence_pr2.m(1KB)
--------exportfig.m(33KB)
----R()
--------script_ProcessingGSE29614_2007.R(3KB)
--------script_ProcessingGSE29617_2008.R(3KB)
--------Annotation.R(5KB)
--------script_pma_influenzadata_FINAL.R(4KB)
--------script_wspca_pma_boxplots_final_Prandom.R(8KB)
----README.md(3KB)
----DATA()
--------DATA2008.mat(10.01MB)
--------GSE29614_pdata.txt(837B)
--------GSE29614_RLparsD3.txt(53B)
--------GSE29617_titers.txt(21KB)
--------DATA2007.mat(3.42MB)
--------GSE29617_RLparsD3.txt(54B)
--------GSE29614_titers.txt(8KB)
--------GSE29617_pdata.txt(2KB)
--------GSE29614_RLparsD0.txt(53B)
--------GSE29614_rma.txt(12.77MB)
--------readme(7B)
--------GSE29617_RLparsD0.txt(54B)