文件名称:psf的matlab代码-VIPR-Vectorial-Phase-Retrieval-for-microscopy:用于显微镜的VIPR向量
文件大小:7.12MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-12 23:38:08
系统开源
psf的matlab代码VIPR-显微镜矢量相位检索 概述: 该代码与以下文章相关:“ VIPR:相位检索的矢量实现,用于快速准确的微观像素级光瞳估计2020”。 该代码从一组具有预定义坐标的图像(用于z堆栈或任何常规设计)生成一个相位掩模,主要针对高NA物镜进行了优化。 打开“ TP蒙版上的示例”以获取有关如何使用代码的更多详细信息。 有关未来更新的注意事项 即将添加python版本。 其他软件使用: •Yair M. Altman编写的Finobj.mat,用于处理图。 一般准则: •在配备I7 8750H CPU和NVIDIA GeForce 2070RTX的笔记本电脑上进行了评估和测试。 •在MATLAB 2019a上设计,带有图像处理和优化工具箱。 •像MATLAB图像一样定义了图像坐标系(x是正确的,y是向下的)。 工作流程: 下载除gif以外的所有文件(对于演示图像,请勿移动文件位置) 打开``主要'' 选择数据集(对于您的数据,data_set = 1,对于EPFL挑战Double Helix数据,data_set = 3,对于演示TetraPod堆栈,data_set
【文件预览】:
VIPR-Vectorial-Phase-Retrieval-for-microscopy-master
----findjobj.m(167KB)
----GDM_phasemask_SGDdirect_gpu.m(13KB)
----PSF_generator.m(3KB)
----init_input_EPFL.m(1004B)
----coords.jpg(49KB)
----pre_comp_opt.m(5KB)
----VIPR_load_data.m(687B)
----CostPR_gpu.m(7KB)
----input_stack.m(2KB)
----TP images()
--------NFP_pos_TP_images.mat(377B)
--------desc(1B)
--------TP_im.tif(694KB)
----EPFL DH data()
--------sequence-as-stack-Beads-DH-Exp.tif(6.5MB)
--------activations.csv(37KB)
--------desc(1B)
----PR_coverslip_data.m(5KB)
----README.md(7KB)
----init_input.m(956B)
----load_data_stack.m(724B)
----periodiccolormap2.mat(1KB)
----CostPR_gpu_init.m(5KB)
----VIPR_user_input.m(3KB)
----Example on TP mask .pdf(430KB)
----gifs()
--------DH_PSF.gif(1.15MB)
--------TP_PSF.gif(1.68MB)
----CostgBlur.m(2KB)
----Main.m(5KB)
----EPFL_data_load.m(1KB)