文件名称：DIY Genomics-开源
文件大小：378KB
文件格式：GZ
更新时间：2024-05-17 18:51:24
开源软件
DIY基因组学是一个开放源代码生物信息学联盟，旨在将一系列工具和库带入小型基因组学实验室，以进行序列组装和注释过程。 项目包括DIYA，MGAP，CRISPR和DIYGV
【文件预览】：
diya-1.0-rc4
----diya.conf(1KB)
----t()
--------01_diya.t(6KB)
--------02_assemble_pseudocontig.t(1KB)
--------data()
--------03_tRNAscan.t(2KB)
--------06_blast.t(1KB)
--------08_multifile.t(1KB)
--------09_blastpCDS.t(2KB)
--------05_tRNAscan-sge.t(1KB)
--------lib()
--------07_formatdb.t(1KB)
--------tmp()
--------04_tRNAscan-glimmer.t(1KB)
----LICENSE(34KB)
----examples()
--------rnammer.conf(796B)
--------blastpCDS.conf(1KB)
--------rename-and-formatdb.pl(830B)
--------extractCDS.pl(963B)
--------rpsblastCDS.conf(911B)
--------download-and-annotate.conf(1KB)
--------download-and-format.conf(813B)
--------cleanup.sh(143B)
--------genome-annotator-fasta.conf(3KB)
--------convert2fasta.pl(569B)
--------formatdb.sh(135B)
--------genome-annotator.conf(4KB)
--------download-genome.pl(1009B)
----scripts()
--------diya-postrun_hook.pl(5KB)
--------diya-genbank2gff3.pl(11KB)
--------gbconvert.pl(12KB)
--------diya-assemble_pseudocontig.pl(19KB)
--------diya-genbank2gff.pl(536B)
----INSTALL(1KB)
----lib()
--------diya.pm(55KB)
--------diya()
----docs()
--------diya.html(44KB)
--------conf.dtd(592B)
----README(2KB)
----Makefile.PL(552B)
----diya.pl(1KB)
----MANIFEST(2KB)