文件名称：Gen_Assoc
文件大小：2.66MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-24 12:47:45
CSS
该程序以R语言编码，并作为包含以下内容的主文件夹（例如，在此处命名为“ mTDT”）提供： 1个子文件夹“ libs”，其中包含R脚本“ modules.R”，用于程序定义 1个R脚本“ mtdt.R”，主程序 3个示例输入文件：“ MTDT_pedfile.ped”，“ MTDT_phenfile.phen”和“ MTDT_mapfile.map”。 输入文件格式 3个输入文件中的任何一个都没有标题 所有输入文件中的列都用制表符分隔 （i）PED文件：从6列开始，然后是基因型列，遵循以下顺序： - family ID - individual ID - Father ID - Mother ID - sex - affection (this column will not be taken into account, but its presence is required)
【文件预览】：
Gen_Assoc-master
----.gitignore(503B)
----Rules & restrictions for the m-TDT tool(631B)
----Gaui()
--------.gitignore(68B)
--------gh3.js(7KB)
--------package.json(1KB)
--------package-lock.json(54KB)
--------kernel(520B)
--------assets()
--------menu.js(5KB)
--------utils.js(4KB)
--------mtdt.R(5KB)
--------template()
--------config.json(684B)
----README.pdf(161KB)
----Environment()
--------Linux_tools.sh(12KB)
--------README.md(2KB)
--------setup_tools.py(12KB)
--------arch.c(311B)
----guih3()
--------gh3.py(39KB)
--------mtdt_setting.json(81B)
--------fileOps.py(3KB)
--------utils.py(1KB)
--------README.md(78B)
--------Changelog.md(0B)
--------hsyrs.py(0B)
--------note_integration(223B)
----scripts()
--------__MACOSX()
--------Run_mtdt_gi.R(6KB)
--------genoInference.R(13KB)
--------mtdt.R(5KB)
--------libs()
--------mendel_table.tsv(290B)
--------genotype_inference.zip(494KB)
--------run_analysis.R(7KB)
--------mTDT.zip(179KB)
--------summary.R(4KB)
----README.md(4KB)
----README.txt(4KB)
----test()
--------MTDT_phenfile.phen(8KB)
--------sample.phen(8KB)
--------MTDT_pedfile.ped(53KB)
--------25markers.zip(10KB)
--------sample.ped(18.36MB)
--------MTDT_mapfile.map(19B)
--------3_pheno.phen(13KB)
--------sample.map(233KB)