pydicom-seg:用于DICOM-SEG医学分割文件读取和写入的Python软件包

时间:2024-05-28 07:26:35
【文件属性】:

文件名称:pydicom-seg:用于DICOM-SEG医学分割文件读取和写入的Python软件包

文件大小:116KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-28 07:26:35

python dicom medical medical-imaging segmentation

pydicom-seg 使用作为DICOM序列化/反序列化库来读取和写入医学图像分割存储文件。 有关支持的功能和用法的详细说明,请参阅。 动机 项目在一段时间内将DICOM-SEG文件转换为ITK兼容的数据格式(通常用于研究)成为可能。 但是,该项目是用C ++编写的,仅通过二进制文件itkimage2segimage和segimage2itkimage提供对转换的访问。 将DICOM-SEG文件转换为ITK NRRD文件格式后,用户必须在输出目录中扫描生成的文件,分别加载它们,并可能将多个文件组合为所需的格式。 该库旨在通过提供对numpy和SimpleITK支持的Python读写功能,来SimpleITK 。 另外,开箱即用地支持诸如加载多类细分之类的常见用例。 安装 从PyPI安装 pip install pydicom-seg 从源安装 该软件包使用 (版本> = 1.0.5)


【文件预览】:
pydicom-seg-master
----poetry.lock(50KB)
----.gitignore(2KB)
----pyproject.toml(897B)
----.pre-commit-config.yaml(547B)
----.isort.cfg(161B)
----LICENSE(1KB)
----.gitmodules(117B)
----.github()
--------workflows()
----README.md(4KB)
----tests()
--------test_dicom_utils.py(4KB)
--------test_writer.py(9KB)
--------test_segmentation_dataset.py(17KB)
----pydicom_seg()
--------writer_utils.py(5KB)
--------writer.py(11KB)
--------__init__.py(271B)
--------reader_utils.py(3KB)
--------externals()
--------template.py(7KB)
--------dicom_utils.py(3KB)
--------reader.py(12KB)
--------segmentation_dataset.py(15KB)
----.flake8(131B)
----docs()
--------install.rst(1KB)
--------Makefile(634B)
--------api.rst(723B)
--------index.rst(1KB)
--------conf.py(2KB)
--------_static()
--------make.bat(795B)
--------license.rst(76B)
--------guides()
--------citation.rst(893B)
----mypy.ini(192B)

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