文件名称：matlab与ccs生成代码-ManifoldEM_Matlab:歧管EM_Matlab
文件大小：413KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-10 02:45:20
系统开源
matlab与ccs生成代码歧管EM 1.0.0 ManifoldEM是一个独立的MATLAB程序，可从单粒子低温电子显微镜数据中提取连续的构象变化。 它是由威斯康星大学密尔沃基分校（UWM）的Ourmazd研究小组开发的。 在以下出版物中介绍了适用于不同实验数据集的基础方法。 Dashti，A。等。 核糖体的轨迹为布朗纳米机。 美国国家科学院院刊111，17492-7（2014）。 Dashti，A.，Mashayekhi，G.，Shekhar，M.等。 从单粒子快照中检索生物分子的功能途径。 Nat Commun 11，4734（2020）。 如果ManifoldEM对您的工作有用，请引用论文1和2。 概述 该软件需要具有指定方向和散焦值（对准文件）的Cryo-EM快照（对准的粒子图像）。 为了预处理数据并提取方向和相关参数，可以使用任何软件。 在此存储库中，提供了一个MATLAB函数（getStarFile.m）从.star文件中提取信息，并将其放入ManifoldEM的适当格式中。 至于图像堆栈，默认设置是.mrcs文件。 但是可以为任何其他数据格式开发此类文件/设置，以使其与
【文件预览】：
ManifoldEM_Matlab-master
----Codes()
--------Utilities()
--------GUI_ManifoldEM_1_0_0.m(35KB)
--------MainScriptsnFaunctions()
--------GUI_ManifoldEM_1_0_0.fig(43KB)
----Tutorial ManifoldEM.docx(292KB)
----Read Me.docx(23KB)
----Copying.rtf(39KB)
----ExtraCodes()
--------create_star.perl(1KB)
--------reconst.perl(409B)
--------scriptRemoveCluster.m(812B)
--------reconst_symm_par.perl(286B)
--------SVDonVolumes.m(3KB)
--------readEMFile.m(542B)
--------scriptgetNLSAres.m(1KB)
--------readNLSAFile.m(609B)
--------removeClusterManual.m(2KB)
--------setup_data.perl(510B)
--------scriptgetEMres.m(1KB)
----License Notice.rtf(3KB)
----README.md(5KB)