文件名称:论文研究-基于Relief和SVM-RFE的组合式SNP特征选择.pdf
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更新时间:2022-08-11 14:39:54
单核苷酸多态性,全基因组关联研究,特征选择,过滤式,缠绕式,组合式
针对SNP的全基因组关联分析面临SNP数据的高维小样本特性和遗传疾病病理的复杂性两大难点, 将特征选择引入SNP全基因组关联分析中, 提出基于Relief和SVM-RFE的组合式SNP特征选择方法。该方法包括两个阶段:Filter阶段, 使用Relief算法剔除无关SNPs; Wrapper阶段, 使用基于支持向量机的特征递归消减方法(SVM-RFE)筛选出与遗传疾病相关的关键SNPs。实验表明, 该方法具有明显优于单独使用SVM-RFE算法的性能, 优于单独使用Relief-SVM算法的分类准确率, 为SNP全基因组关联分析提供了一种有效途径。