DBS-OCP:DBS用于单核中的开放染色质分析

【文件属性】：

文件名称：DBS-OCP:DBS用于单核中的开放染色质分析

文件大小：1.2MB

文件格式：ZIP

更新时间：2024-04-18 13:34:31

Python

DBS-OCP DBS用于单核中的开放染色质分析 安装 克隆DBS-OPC github git clone https://github.com/AfshinLab/DBS-OCP 使用conda安装environment.yaml文件的基本环境： conda env create -n dbsopc -f environment.yaml 安装DBS-OPC软件包： pip install . 为了进行开发，可以使用pip install -e .以可编辑模式安装该软件包pip install -e . 。 要在Upp​​max Bianca群集上进行安装，请遵循以下。 运行分析 所需输入： 配对的FASTQ文件 BWA索引参考 设置分析目录称为my_workdir ： dbsocp init --read1 /path/to/read.1.fastq.gz my_work

【文件预览】：
DBS-OCP-main
----pyproject.toml(142B)
----environment.yml(527B)
----.github()
--------workflows()
----tests()
--------testdata()
--------test_cli.py(2KB)
----LICENSE(1KB)
----src()
--------dbsocp()
----setup.cfg(927B)
----doc()
--------knowledge.md(2KB)
--------bianca_install.rst(2KB)
----setup.py(69B)
----.gitignore(2KB)
----README.md(1KB)