BiocLyon2015:2015年法国里昂课程资料

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更新时间:2024-05-19 15:28:27

本课程广泛介绍了使用R和Bioconductor进行高通量序列数据的分析和理解; 没有讨论许多其他有用的软件工具。 要解决的主题和学习目标如下: 生物导体简介:熟悉整体序列分析工作流程。 生物导体应对的分析挑战的多样性。 生物导体包装在特定工作流程步骤中的作用。 生物导体资源,以帮助和有效利用。 下一代测序数据处理:常见的基因组文件类型(FASTA / FASTQ,BED,WIG,GTF等)及其生物导体表示和操作。 基本生物导体数据结构(例如DNAStringSet,GenomicRanges)。 生物导体基因和基因组“注释”资源。 适用于常见生物信息任务的简单Bioconductor解决方案。 主要软件包:GenomicFiles,GenomicRanges,GenomicFeatures,ShortRead,Biostrings。 变异调用和注释:对变异调用方法和(主要是非生物导


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BiocLyon2015-master
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