PPClustA:闪亮的APP可视化Golub等人测量的基因表达

时间:2024-05-06 17:38:07
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文件名称:PPClustA:闪亮的APP可视化Golub等人测量的基因表达

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更新时间:2024-05-06 17:38:07

R

聚氯乙烯 PPClustA软件包中包含一个闪亮的APP,用于探索和可视化Golub等人的急性淋巴白血病(ALL)和急性髓性白血病(AML)患者的基因表达数据。 应用主成分分析和层次聚类方法。 所需的包 安装 您可以使用 install_github()函数从安装当前版本的PPClustA: if ( ! requireNamespace( " devtools " , quietly = TRUE )) install.packages( " devtools " ) devtools :: install_github( " ECSchmitt/PPClustA " ) 包装背后的一些理论 在查看许多个体中许多基因的,我们面临着大量信息。 这样的数据是多维的,因此需要进行简化以使我们可以理解而又不会丢失重要的信息。 对于Golub数据,作者对发现和区分新的癌症亚型感兴趣。 但是,我


【文件预览】:
PPClustA-master
----PPClustA.Rproj(433B)
----README.Rmd(13KB)
----man()
--------figures()
--------load_expr_data.Rd(812B)
--------chg_rownames.Rd(753B)
--------extract_gene_names.Rd(586B)
--------runapp.Rd(410B)
--------replace_zeros.Rd(538B)
----NAMESPACE(154B)
----.Rbuildignore(42B)
----.gitignore(40B)
----R()
--------load_expr_data.R(1KB)
--------replace_zeros.R(457B)
--------runapp.R(4KB)
--------chg_rownames.R(686B)
--------extract_gene_names.R(685B)
----DESCRIPTION(797B)
----README.md(14KB)

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