genipe:全基因组估算流程

时间:2024-06-11 08:53:10
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文件名称:genipe:全基因组估算流程

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更新时间:2024-06-11 08:53:10

bioinformatics genomics genetics Python

genipe-执行全基因组插补分析的Python模块 该genipe模块(代表GEN OME宽我mputation P ipelin E)包括脚本(名为genipe-launcher )自动运行使用的Plink,shapeit和impute2全基因组归集管道。 如果您在任何已发表的作品中使用genipe ,请引用描述该工具的论文: Lemieux Perreault LP,Legault MA,Asselin G, DubéMP:genipe:具有自动报告和统计工具的全基因组自动估算管道。 生物信息学2016年,32(23):3661-3663(DOI: )。 文献资料 完整的文档可从。 安装 genipe 1.5.0 genipe应与软件包的最新版本一起使用。 我们建议将软件包安装在Python 3.7(或最新版本)虚拟环境中。 有两种安装方式: pip或conda 。 #


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