文件名称:matlab图片叠加的代码-Begonia:星形细胞Ca2+信号的双光子成像分析管线
文件大小:5.9MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-12 13:43:37
系统开源
matlab图片叠加的代码秋海棠 秋海棠是由Matlab开发的框架,可帮助解决星形胶质细胞2光子成像数据的科学图像分析的一些核心挑战。 它的一些功能包括:(1)简单且维护成本低的元数据存储策略;(2)将手动分析步骤与自定义的Matlab工具集成在一起;(3)处理与镜筒类型/图像来源无关的图像数据;(4)加入时间来自多个测量设备和来源的一系列数据,以及(5)使用动态钙传感器对可见的成像细胞和组织事件进行自动或半自动分析。 该开发的主要重点是星形细胞钙信号传导,但该软件可用于2-光子激光显微镜记录的一系列荧光指示剂。 该系统为非程序员提供了一些图形化的工作流程,并为程序员提供了一个API。 我们发现GUI工具和Matlab处理API的结合效果很好,并且由其他人提供更多编程经验,他们支持的研究人员可以在此框架下实现高生产率。 非程序员可以最初使用该框架来概述数据并进行自动分析,以进行项目试点或在收集数据时快速查看数据。 已知的问题 :warning: 使用RoI管理器(“ roiman”)时,请注意以下几点: 如果在窗口中单击以提高时间序列视图,则有一个错误会阻止roimanager获取键盘事件。 解决方