文件名称：matlab图片叠加的代码-warping:翘曲
文件大小：20.15MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-12 13:21:59
系统开源
matlab图片叠加的代码在Neuron的出版物中附有该原位翘曲至体内图像的代码。 缠绕包装矢量 打开FIJI ImageJ并安装warpingvectors.ijm宏。 在“插件/宏”菜单中，运行align_patch宏以进行堆栈的粗略初始对齐。 根据提示，使用多点工具在参考堆栈和源堆栈上选择3个匹配点，以将源堆栈粗略地对齐到参考堆栈。 处理上面生成的红色/绿色叠加层以绘制变形矢量（从源点到目标点）。 开始之前，请确保ROI管理器和“结果”表均为空。 通过按下工具栏中的“记录”图标（实心圆）来激活绘图工具。 单击并拖动（通常从红色到绿色）以绘制矢量。 按“ d”将删除最后一个向量。 按“ s”将保存数据（选择.tsv扩展名以另存为制表符分隔的值）。 按“ l”会将保存的数据从.tsv文件加载回结果/ ROI 完成后，将结果另存为.tsv文件，在下一部分中将其用作[VECTOR_FILENAME]。 包裹 设置所需的软件 在Windows或Mac上使用Anaconda 如果没有，请安装。 在Windows上，请使用Anaconda Prompt（您可能必须以管理员身份运行）执行以下步骤
【文件预览】：
warping-master
----warp.py(13KB)
----Dockerfile(2KB)
----matlab()
--------expanded_ROI.m(317B)
--------Info()
--------bigread2.m(5KB)
--------calculate_n_draw_small.m(9KB)
--------GUI_neuropil.fig(95KB)
--------Initial_neuropil.m(5KB)
--------cell2csv.m(2KB)
--------initiate_options.m(2KB)
--------load_n_crop.asv(1KB)
--------save_corr_ROIs.m(342B)
--------load_n_crop.m(1KB)
--------df_over_f.m(577B)
--------testing.m(843B)
--------calculate_n_draw_small_safety.m(9KB)
--------GUI_neuropil.m(12KB)
--------calculate_n_draw.m(10KB)
--------main_neurop_sub.m(5KB)
--------Initial_neuropil.fig(10KB)
--------expandPolygon.m(3KB)
--------ReadImageJROI.m(15KB)
----imagej()
--------warpingvectors.ijm(5KB)
----requirements.txt(108B)
----docker-compose.yml(86B)
----.gitignore(11B)
----README.md(6KB)
----jupyter_notebook()
--------activity-final.html(13.83MB)
--------activity-final.ipynb(13.47MB)