generand:生成FASTAFASTQ,SAM或VCF格式的随机基因组数据

时间:2024-04-04 00:10:40
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文件名称:generand:生成FASTAFASTQ,SAM或VCF格式的随机基因组数据

文件大小:8KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-04 00:10:40

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慷慨的 生成FASTA / FASTQ,SAM或VCF格式的随机基因组数据,输出到标准输出。 输出数据是完全随机的,适合于新程序的基本测试和基准测试,或用于学术目的快速生成小样本。 Generand对于动态生成大型测试输入特别有用,因此无需手动生成和/或存储它们。 当前,随机化非常简单,但是将来我们可能会添加参数,以允许针对特定情况生成更实际的数据。 用法 Fasta通用序列,序列长度 fastq序列的序列长度 通用山姆染色体比对-每染色体序列长度 常规vcf染色体每染色体检出率 描述 Generand Fast [aq]序列序列长度 生成“序列”序列的FASTA或FASTQ流,每个序列的长度为“ sequence-length”。 序列含量是随机的,碱基分布均匀,因此GC含量应非常接近50%。 FASTQ流中的PHRED分数以相等分数的块生成,并且大多数都是高质量的。 最后的几个


【文件预览】:
generand-main
----.gitignore(20B)
----Makefile(6KB)
----generand.1(2KB)
----LICENSE(1KB)
----Makefile.depend(55B)
----README.md(2KB)
----generand.c(8KB)

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