文件名称:VaxDesign:一种通过脚本设计疫苗的脚本
文件大小:12KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-02-21 09:28:13
protein-data-bank protein-structure scaffold motif ab-initio
VaxDesign 通过计算设计疫苗的脚本。 要求 下载此脚本: wget https://raw.githubusercontent.com/sarisabban/VaxDesign/master/VaxDesign.py 使用以下命令(在Ubuntu GNU / Linux中)安装所有必要的程序和Python库,以使该脚本成功运行: sudo apt update && sudo apt install gnuplot dssp python3-bs4 python3-biopython python3-lxml -y 确保按照网站上的说明安装 。 描述 该脚本从用户指定的目标位置自主设计疫苗。 最好使用包含与受体或抗体结合的靶位点的结构,因为这些结构将用于指导疫苗的开发。 一旦您确定了目标位点,该脚本便会将其嫁接到支架蛋白质结构上,而无需您进行干预,并对其进行设计,从而形成理想的蛋白质结构,以其原始3D配置显示目标位点。 因此,从理论上讲,蛋白质可以用作针对该部位的疫苗,并有望中和您正在研究的疾病。 运行脚本将导致具有不同序列的多种蛋白质结构。 最好使用这些结构并对其进
【文件预览】:
VaxDesign-master
----LICENSE(1KB)
----VaxDesign.py(27KB)
----README.md(9KB)
----_config.yml(26B)