文件名称：vernaml:我的comp402项目的存储库
文件大小：126.56MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-25 21:22:36
Python
病毒RNA 项目目标 该项目的总体目标是为生物学家提供一种可预测RNA结合伴侣和功能的工具。 目前，RNAMigos预测小分子结合伴侣，但是我想将其扩展到预测蛋白质和功能注释。 该任务将使用来自VeRNAl的图案指纹以及来自PDB，Rfam和GO的数据。 首先，我们将依靠可解释的预测模型（即决策树）来确定主题的重要性。 总体结果将是清理和整理的数据源； 调整了VeRNAl基序提取的参数； 训练有素的RNA- {蛋白质/ RNA /小分子/功能}预测分类模型，以及有关保守RNA结构模式的新颖功能见解。 关联存储库： 1.数据准备 VernaML的训练数据由netowrkx图组成，这些图被切成包含RNA接口及其对应的补体对应物的部分。 图是增强碱基配对网络。 这是一个覆盖在PDB结构上的示例。 主干为白色，规范的Watson-Crick键为绿色，非规范键为红色。 要生成此数据： 检索一组代