matlab离差分析代码-PointPatternQuest:点模式任务

时间:2024-06-22 15:25:53
【文件属性】:

文件名称:matlab离差分析代码-PointPatternQuest:点模式任务

文件大小:68KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-22 15:25:53

系统开源

matlab离差分析代码使用空间分散分析代码的指南 塞巴斯蒂安赫伯特 Matlab 版本 R2017b 所需的 Matlab 库 对于动态模式中的细胞类型分散: 预处理数据文件 => extractDuplicateAndFormatDyn.m 使用extractDuplicateAndFormatDyn.m函数将Imaris 以.csv 格式导出的单元格类型重新格式化为单个MATLAB 文件。 处理过程还会检查文件中是否有重复项。 此函数将询问 3 种预期的细胞类型。 以 csv 文件为例。 (注意:type 1 种群可以有 1 个以上的输入文件,母细胞被复制到 type2 种群中) 每个文件都将转换为一个 MATLAB 表,并与其他文件连接并测试重复项。 重复有 3 种: 重复的细胞是type2和mother 重复的单元格属于相同的单元格类型 重复的单元格属于不同的单元格类型(不是母单元格)=> 只有这种情况会导致函数抛出错误消息,提示用户检查应使用哪种格式(通常通过返回 Imaris)。 如果文件被正确设置和提供,输出应该是一个由 N 行(即单元格数)组成的 8 个变量表。 变量


【文件预览】:
PointPatternQuest-master
----.gitignore(528B)
----extractDynNN.m(4KB)
----oldScripts_fromWS()
--------MatlabPatternAnalysisFunctions()
--------subFunctions()
--------ImarisDataCheck.m(10KB)
--------DataAnalysis.m(5KB)
--------DuplicateSpots.m(2KB)
----README.md(4KB)
----simulateDynDispersion.m(5KB)
----pointDynPatternMain.m(6KB)
----dataParsing()
--------mergeCloseCells.m(4KB)
----displayFunctions()
--------RMSmap_display.m(2KB)
--------extract_data_bioCompare.m(8KB)
--------call4NNDisplay.m(1KB)
--------expVScsr_display.m(4KB)
--------displayNNCDFs.m(2KB)
----combineAndCompareNN.m(17KB)
----LICENSE(1KB)
----anaDynNN.m(2KB)
----extractDuplicateAndFormatDyn.m(6KB)
----displayModelSerie.m(3KB)
----displaySimuPPQ.m(2KB)
----displayDynNNmap.m(2KB)
----dataPreprocessing()
--------formatDataDynToStat.m(3KB)
----pointPatternMain.m(11KB)
----checkImarisCSVForDuplicates.m(4KB)
----errorRMSmap.m(8KB)
----mergeDynNN.m(2KB)
----pointPatternFNNAnalysis.m(13KB)
----displayDynNNisomap.m(1KB)
----pointDynPatternAnalysis.m(11KB)

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