文件名称：ExAC:将 ExAC 数据导入管道
文件大小：668KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-16 15:45:17
Java
ExAC 来自 master 的变化 来自上游的变化，用于 saito test 创建分支基因组中心 ExAC 概述 该项目是为将 ExAC 数据导入管道而开发的。 检查已在 ExAC 的 VCF 文件中注册的每个样本的 SNV 位置。 关于 ExAC 数据库 麻省理工学院布罗德研究所。 链接： : 2014 年 10 月发布的 61,486 人（包括 4,378 名亚洲人）外显子组数据（0.2 版） 9,462,741 个变异位置 过滤器：DP >= 10 & GQ >= 20 2.9GB (gzip) aaaaaaaaaaaaa VCF 规范 (v4.1) 示例程序 (getExAC.pl) 读取每行的 VCFfile 导入 chr, pos, alt, AC, AC_EAS, AN, AN_EAS 到 hash-table (key: chr, pos) 从每个
【文件预览】：
ExAC-master
----.gitignore(189B)
----src()
--------test.txt(24B)
--------.DS_Store(6KB)
--------vcfstream()
----bin()
--------test.txt(24B)
----.classpath(226B)
----LICENSE(1KB)
----.DS_Store(6KB)
----README.md(2KB)
----.project(363B)
----ref_files()
--------getExAC.pl(1023B)
--------VCFv4.1.pdf(665KB)