文件名称：BeeDeeM:生物信息学数据库管理系统
文件大小：231.37MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-09 11:42:50
Java
BeeDeeM ：生物信息学数据库管理系统 BeeDeeM是一个通用的乙ioinformatics d atabank中号anager。 它提供了一套命令行和UI软件，用于安装和使用主要序列数据库和生物学分类。 它是的理想伴侣。 主要特点 BeeDeeM自动执行： 从远程站点下载数据库文件（通过FTP，Aspera）， 解压缩文件（gzip文件）， 解压缩文件（tar文件）， 本地序列库（例如Genbank）到FASTA文件的转换， 从本地序列库格式以BLAST格式准备数据库， 对Genbank，Refseq，Embl，Genpept，Swissprot，TrEmbl，Fasta，Silva和BOLD文件建立索引，从而可以通过序列标识符进行高效查询， 序列特征和本体数据（NCBI分类法，基因本体论，酶委员会和Intepro域）的索引， 从带注释的序列库中准备分类学子集，