文件名称：gbmunge:Munge GenBank文件进入FASTA和制表符分隔的元数据
文件大小：6.98MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-28 04:01:15
C
gbmunge 将Munge GenBank文件转换成FASTA序列和制表符分隔的元数据。 这个小C程序将从GenBank文件中提取以下信息： 名称 加入 长度 提交日期 主持人 国家 采集日期 除了提取此信息外，还对日期进行了重新格式化，例如31-DEC-2001变为2001-12-31 ，这使得它们对于诸如BEAST之类的下游软件更易于消化，并且清理了国家名称并使其与ISO3代码匹配。 用法 gbmunge [-h] -i < Genbank> -f < sequence> -o < metadata> [-t] [-s] Genbank_file ：GenBank格式的序列文件的文件名（通常以sequence.gb下载） sequence_output ：FASTA输出的文件名 metadata_output ：制表符分隔的元数据
【文件预览】：
gbmunge-master
----.gitignore(442B)
----Makefile(51B)
----src()
--------gbfp.h(2KB)
--------Makefile(251B)
--------gbmunge.c(15KB)
--------gbfp.c(25KB)
----LICENSE(1KB)
----README.md(2KB)
----Make.inc(272B)
----test()
--------sequence.txt(25KB)
--------sequence.fas(7.45MB)
--------sequence.gb(15.45MB)