EvaNIL：用于大型NIL实体链接评估的Silver标准数据集

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文件名称：EvaNIL：用于大型NIL实体链接评估的Silver标准数据集

文件大小：59KB

文件格式：ZIP

更新时间：2024-03-10 17:36:41

Python

依凡妮 用于大型NIL实体链接评估的Silver标准数据集。 从现有的生物医学和生命科学语料库构建而成。 设定环境 Dockerfile包含用于在适当的环境中设置Docker映像的命令。 检索必要的数据 要下载所需的知识库和语料库文件： ./download_data.sh 建立资料集 要构建数据集的给定分区： python src/dataset.py 精氨酸 分区：要构建的选定分区。 选项： “医学”（CTD-MEDIC） “ ctd_anatomy”（CTD解剖） “ ctd_chemicals”（CTD-Chemicals） “ chebi”（ChEBI） “ go_bp”（GO生物过程） “ hp”（HPO） 例子： python src/dataset.py chebi 输出：./dataset/chebi目录中的train.js

【文件预览】：
EvaNIL-main
----evaNIL.png(47KB)
----Dockerfile(137B)
----LICENSE(11KB)
----src()
--------statistics.py(3KB)
--------utils.py(2KB)
--------dataset.py(4KB)
--------kbs.py(5KB)
--------annotations.py(14KB)
--------baseline.py(6KB)
----baseline_results.csv(218B)
----stats.csv(890B)
----requirements.txt(27B)
----README.md(3KB)
----sample.json(2KB)
----download_data.sh(2KB)