文件名称：miRNA-seq_pipeline
文件大小：55KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-20 01:55:45
R
==================== microRNA 测序 为 microRNA 测序分析管道创建存储库 包含用于 microRNA 测序数据分析的所有自定义 linux bash 脚本、perl 脚本和 R 脚本的存储库。 为了使用提供的管道和脚本，用户应该首先参考 miRNA-seq_QC_filter.txt 文件，这将导致其他不同的脚本。 以后可能会为每个脚本添加更多的README文件，以方便用户的使用和理解。 有关我们的文章或存储库的任何查询，请联系： 北卡罗来纳州 或者 Correia, C. 或者 麦克休，DE DOI 徽章： :
【文件预览】：
miRNA-seq_pipeline-master
----Linux_bash_scripts()
--------Novoalign-featureCounts.txt(11KB)
--------Sequencing_depth_pipeline.txt(8KB)
--------miRdeep-star.txt(4KB)
--------miRNA-seq_QC_filter.txt(12KB)
--------miRdeep2.txt(5KB)
----Perl_scripts()
--------Get_isomiR_count.pl(21KB)
--------Fasta_keep_value.pl(3KB)
--------miRNA_info_grepping.pl(5KB)
--------Fasta_ignore_value.pl(3KB)
--------gff2gtf.pl(2KB)
----.gitattributes(378B)
----R_scripts()
--------General_function.R(24KB)
--------miRNAseq_isomiR_edgeR_pipeline.R(30KB)
--------RT-qPCR_DE_pipeline.R(10KB)
--------miRNAseq_edgeR_pipeline.R(38KB)
----README.md(806B)
----License.md(18KB)