文件名称:Python-fastTSNEtSNE的快速并行实现
文件大小:617KB
文件格式:ZIP
更新时间:2022-09-01 02:45:17
Python开发-机器学习
使用FFT加速插值和近似最近邻居在11分23秒内计算来自小鼠神经系统[Zeisel 2018]的160,796个单细胞转录组的可视化。
【文件预览】:
pavlin-policar-openTSNE-44b7a07
----fastTSNE()
--------callbacks.py(4KB)
--------_tsne.pxd(2KB)
--------_tsne.pyx(42KB)
--------quad_tree.pxd(574B)
--------__init__.py(60B)
--------_tsne.c(1.4MB)
--------kl_divergence.pyx(4KB)
--------metrics.py(250B)
--------quad_tree.c(833KB)
--------kl_divergence.c(994KB)
--------nearest_neighbors.py(1KB)
--------affinity.py(6KB)
--------quad_tree.pyx(6KB)
--------tsne.py(26KB)
----benchmarks()
--------__init__.py(0B)
--------data()
--------benchmark_tsne.py(9KB)
----notes()
--------notes.tex(19KB)
--------notes.pdf(169KB)
--------.gitignore(34B)
--------references.bib(3KB)
----setup.py(1KB)
----README.md(3KB)
----tests()
--------__init__.py(0B)
--------test_tsne.py(14KB)
--------test_correctness.py(2KB)
--------quad_tree_debug.pyx(2KB)
----.gitignore(75B)