bio-locus:生物位点

时间:2024-05-29 12:36:40
【文件属性】:

文件名称:bio-locus:生物位点

文件大小:42KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-29 12:36:40

Ruby

生物位点 生物基因座是一种用于快速查询基因组位置的工具。 生物信息学中的许多文件格式都包含以染色体名称和SNP位置或插入/缺失起始位置开头的记录。 该工具实际上使您可以在快速数据库中存储此chr + pos或chr + pos + alt信息。 为什么要使用生物基因座? 快速比较VCF文件和其他使用chr + pos的格式 快速比较VCF文件和其他使用chr + pos + alt的格式 查看哪些位置与EVS或GoNL数据库匹配 比较来自TCGA和COSMIC等数据库的位置 比较重叠或差异 解析并存储值以供以后重用(nyi) 店铺搜寻职位(nyi) 生物场所与tabix有何不同? Tabix是表格数据的快速索引器。 生物基因座做类似的事情。 不同的是,生物基因座是在匹配的位置数据更加灵活,是基于行的正则表达式与选择,可以使用其他的后端(RAM,NoSQL的,SQL),并且不使用


【文件预览】:
bio-locus-master
----.travis.yml(225B)
----bin()
--------bio-locus(4KB)
----Rakefile(787B)
----test()
--------data()
----Gemfile(82B)
----VERSION(6B)
----.rspec(8B)
----.document(55B)
----spec()
--------bio-locus_spec.rb(1KB)
--------spec_helper.rb(359B)
----.gitignore(967B)
----lib()
--------bio-locus.rb(375B)
--------bio-locus()
----README.md(7KB)
----LICENSE.txt(1KB)

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