文件名称：Intro-to-rnaseq-hpc-gt:使用HPC的RNA-seq简介
文件大小：18.01MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-05 10:05:24
Shell
使用高性能计算（HPC）的RNA-seq简介 描述 该资料库提供了为期2天的RNA测序数据分析研讨会的教学材料。 该研讨会的重点是教授基本的计算技能，以有效利用高性能计算环境来实现RNA-seq数据分析工作流程。 它包括对shell（bash）和shell脚本的介绍。 除了运行来自FASTQ文件的RNA-seq工作流程以计算数据外，该研讨会还涵盖了RNA-seq实验设计和数据组织/管理的最佳实践准则。 这些材料是为培训师主导的讲习班开发的，但也适合进行自学学习。 学习目标 了解用于分析高通量测序数据的命令行界面（bash）和HPC的必要性和用途。 了解设计RNA-seq实验并分析所得数据的最佳实践。 内容 Shell基础 经验教训 预计时间 70分钟 45分钟 30分钟 75分钟 50分钟 40分钟 HPC和RNA-seq工作流程 经验教训 预计时间 RNA-seq实验设计最佳实践 5
【文件预览】：
Intro-to-rnaseq-hpc-gt-master
----lectures()
--------Intro_to_workshop.pdf(7.43MB)
--------Workshop_wrap_up.pdf(892KB)
--------RNAseq-analysis-methods.pdf(153KB)
--------HPC_intro_genentech.pdf(1.34MB)
--------alignment_and_builds.pdf(2.74MB)
--------rna-seq_design.pdf(2.6MB)
----sam.md(1KB)
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----lessons()
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