matlab清理代码-skeleton3d-matlab:MATLAB代码使用平行的中间轴细化来计算二进制体积的3D骨架

时间:2024-06-13 17:15:20
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文件名称:matlab清理代码-skeleton3d-matlab:MATLAB代码使用平行的中间轴细化来计算二进制体积的3D骨架

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更新时间:2024-06-13 17:15:20

系统开源

matlab清理代码framework3D-matlab:3D二进制体积的平行中间轴细化 此代码计算任意3d二进制体积的3D中轴骨架。 它是[1]中描述的同位稀疏算法的优化MATLAB实现。 我们开发了它来量化骨骼中细胞过程的网络[2],但它应该在任何管状或丝状结构的图像上起作用。 包含示例卷(testvol.mat)和示例脚本(Test_Skeleton3D.m)。 任何意见,更正或建议都非常欢迎。 用法: skel = Skeleton3D(bin) 其中“ bin”是3D二进制图像,而“ skel”仅包含骨架体素的结果图像,或者 skel = Skeleton3D(bin,mask) 从骨架中掩盖“蒙版”中的所有前景体素,例如保留图像体积中的某些结构。 要进行其他清理,例如修剪短分支,请在MATLAB File Exchange上使用我的Skel2Graph3D包。 该代码受Hanno Homann [3]的ITK实现和Ignacio Arganda-Carreras [4]的Fiji / ImageJ插件的启发。 如果您在自己的作品中包含此内容,请引用我们的publicaton


【文件预览】:
skeleton3d-matlab-master
----p_EulerInv.m(4KB)
----pk_get_nh.m(422B)
----p_is_simple.m(1KB)
----Skeleton3D.m(6KB)
----p_oct_label.m(11KB)
----FillEulerLUT.m(2KB)
----testvol.mat(7KB)
----README.md(2KB)
----Test_Skeleton3D.m(599B)
----.gitignore(6B)
----readme.txt(2KB)
----license.txt(1KB)
----pk_get_nh_idx.m(382B)

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