文件名称:frameanalysis:在MDAnalysis中建立残基对的轨迹分析
文件大小:10.6MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-08 03:30:09
Python
轨迹框架分析 中轨迹分析器用于在中测量残渣对距离。该脚本在终端中接受输入文件以定义其输入,分析设置和残基对。 依存关系 1. 负责选择残基原子和坐标以及分析模板。 使用 根据存储库中的模板创建一个input.in文件。残基对之间用空格隔开,所有其他值之间用'='符号隔开。在'3:RUN_SETTINGS'中,布尔值必须大写,如python ex'False'所示。 运行程序 python frameanalysis.py input.in
【文件预览】:
frameanalysis-main
----README.md(750B)
----analysisclass()
--------singleframe()
--------selection()
--------analysis.py(4KB)
----tests()
--------selectiontest.py(2KB)
--------testtraj.dcd(3.75MB)
--------test.py(697B)
--------iotest.py(1KB)
--------test1.in(302B)
--------analysistest.py(2KB)
--------frametest.py(2KB)
--------testtop.psf(910KB)
--------test0.in(259B)
--------test2.in(247B)
----LICENSE(1KB)
----frameanalysis.py(1KB)
----template_input.in(239B)
----test.in(259B)
----data()
--------testtraj.dcd(3.75MB)
----md_in()
--------testtraj.dcd(3.75MB)
--------testtop.psf(910KB)