文件名称：matlab终止以下代码-graph_ensemble:条件随机场模型
文件大小：245KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-10 04:33:20
系统开源
matlab终止以下代码graph_ensemble 韩淑婷，2017年4月，2018年9月; 乔纳森·索尔（Jonathan Shor），2018年6月。 概述 该项目在小鼠V1皮质的体内双光子钙成像数据中应用条件随机场模型。 我们在此类成像数据上建立了CRF，以识别与特定外部刺激相对应的代表性神经元集合，并识别能够执行模式完成的核心神经元。 该代码库基于Jebara集团的回购协议。 此代码仅在linux / macOS平台上进行了测试。 需要MATLAB版本R2016b或更高版本。 示例工作流程脚本需要Python 3.5+。 编译依赖 克隆存储库后，在基本目录中运行make 。 注意：请将thirdparty/QPBO-v1.32.src/Makefile （第19行）中的MEX路径更改为系统中的Matlab路径。 在MacOS上，需要XCode进行编译。 资料格式 两个二进制峰值矩阵应存储在.mat文件中，变量名称为data和stimuli 。 data需要是按神经元数量对应的帧数，与神经元记录相对应。 stimuli需要是按stimuli数量的帧数，对应于每个刺激的存在时间。