文件名称：matlab分裂生长代码-CodeBase:代码库
文件大小：341.64MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-16 13:01:24
系统开源
matlab分裂生长代码一种机制意识和多组学机器学习管道表征了酵母细胞的生长 客观的 此代码使用特定于菌株的代谢建模以及基因表达数据来生成酵母生长的预测模型。 工作流程 步骤1： msb145172数据集（Duibhir等人，2014）用于通过在基线代谢模型上定制基于微阵列的约束条件来创建菌株特异性代谢模型。 第二步： 简约通量平衡分析用于模拟代谢活性并获得菌株特异性React通量。 第三步： 应用了特征选择技术。 我们探索三种最先进的技术： NSGA-II-一种遗传算法，可以实现多个目标 稀疏组套索-分组变量的正则化技术，可促进组稀疏性 迭代随机森林-解释变量之间的非线性相互作用 第四步： 机器学习和深度学习技术被用于生成酵母生长的预测模型，该模型从基因表达，代谢通量以及两者一起开始。 我们使用早期，中期和后期数据集成，探索以下基准方法： 支持向量回归 随机森林 深度神经网络 他们的多视图同行是： 贝叶斯高效多核学习 袋装随机森林 多模态深度神经网络 第五步： 使用实验独立的测试集对通用性进行了测试（Sameith，2015年），还包括一些功能插补，以确保数据与MSB数据一致。 文件
【文件预览】：
CodeBase-master
----.DS_Store(8KB)
----.Rhistory(0B)
----LICENSE(34KB)
----README.md(4KB)
----Code()
--------.DS_Store(10KB)
--------Metabolic_Modelling()
--------Machine_Learning()