文件名称:好用的去噪代码matlab-FANTASIA-CaImAn:幻想曲-加拿大
文件大小:58.49MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-15 12:02:25
系统开源
好用的去噪声代码matlab 凯门MATLAB 一种计算工具箱用于大规模的Ca lcium林老化数据的alysis。 该代码实现了CNMF算法,用于同时从大型钙成像电影中进行信号源提取和峰值推断。 包括更多功能(请参阅下文)。 该代码适用于体细胞成像数据的分析。 将来将增加对树突/轴突成像数据分析的改进实施。 包括的功能和方法 源提取 基于约束非负矩阵分解(CNMF)分离不同的源 处理严重重叠和被神经纤维污染的电影 使用 去噪,去卷积和尖峰提取 从荧光痕迹推断神经活动的受约束foopsi方法 使用OASIS算法进行近乎在线的实施 贝叶斯峰值推断的MCMC算法 处理非常大的数据集 运动校正 使用NoRMCorre算法的快速可并行化的非刚性运动校正。 可以找到单独的独立程序包。 将来它将包含在此软件包中。 新增:重命名为CaImAn-MATLAB 我们将代码移至Flatiron Institute github帐户中,并将存储库重命名为CaImAn-MATLAB,以使其与Python软件包更加紧密地联系。 其他一切都一样。 旧链接https://github.com/epnev/ca_so