scDatasets:处理后的单细胞测序数据集

时间:2024-06-05 13:43:05
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文件名称:scDatasets:处理后的单细胞测序数据集

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更新时间:2024-06-05 13:43:05

rna-seq dataset atac-seq single-cell R

scDatasets 处理后的单细胞测序数据集 1.安装 推荐的scDatasets安装方法是使用devtools库中的install_github命令。 首先,您必须安装软件包。 library( devtools ) install_github( ' gongx030/scDatasets ' ) 在此过程中安装了许多所需的软件包。 2.数据集 scRNA-seq数据集可以通过以下方式加载: library( scDatasets ) library( SummarizedExperiment ) data( pollen ) pollen 这里总结了包含的数据集的名称,数据类型,表达式单位和来源: 名称 数据类型 Expression_Unit 来源 uo 聚合酶链React exp(-Ct) 郭等。 从合子到胚泡的单细胞基因表达分析揭示了细胞命运决定的解决方案。


【文件预览】:
scDatasets-master
----NAMESPACE(155B)
----DESCRIPTION(356B)
----R()
--------scDatasets.r(5KB)
----scDatasets.Rproj(312B)
----LICENSE(1KB)
----README.md(3KB)
----data()
--------trapnell.rda(18.88MB)
--------guo.rda(80KB)
--------deng.rda(6.04MB)
--------loh.rda(7.74MB)
--------petropoulos.rda(32.33MB)
--------guo2.rda(5.69MB)
--------usoskin.rda(7.82MB)
--------iPSC.rda(3MB)
--------pollen.rda(3.82MB)
--------blakeley.rda(783KB)
----man()
--------scDatasets.Rd(323B)
--------deng.Rd(312B)
--------guo.Rd(329B)
--------pollen.Rd(370B)
--------preprocess.Rd(1KB)
--------iPSC.Rd(338B)
--------guo2.Rd(364B)
--------loh.Rd(326B)
--------usoskin.Rd(430B)
--------petropoulos.Rd(348B)
--------trapnell.Rd(298B)
----.gitignore(500B)

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