文件名称：风险模型
文件大小：15.01MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-14 23:36:31
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风险模型 这是一个对COVID-19进行人类挑战试验的风险进行建模的项目，支持现已提交的期刊论文。 此回购协议包括（1）用于与COVID-19感染相关的某些风险的贝叶斯模型，以及（2）量化与参与挑战试验相关的风险的Shiny应用程序。 回购的所有部分都在积极开发中，我们希望它们会发生重大变化。 此仓库的结构 贝叶斯死亡率模型包含在ifr-model/ 。 模型及其结果的PDF摘要位于该文件夹中。 分析是在R中完成的。运行该模型需要Stan程序包。 该模型是独立的（仅复制ifr-model文件夹就足够了）； 所有必需的数据都在ifr-model/data/ 要重新运行模型并重新生成输出，可以运行Rmd文件，但将eval = FALSE选项更改为TRUE 。 默认情况下，不重新运行任何模型。 Shiny应用程序位于ShinyApp/ 该应用程序取决于ifr-model/输出，该输出为
【文件预览】：
RiskModel-master
----paper()
--------arxiv.sty(7KB)
--------risk_estimate_placeholder.png(197KB)
--------Riskestimate.png(63KB)
--------RiskModelInterface.png(54KB)
--------risk_estimate_fig1.png(200KB)
--------Submission Version - Exploring_Risks_of_Human_Challenge_Trials_for_COVID_19.pdf(766KB)
--------references.bib(25KB)
----ifr-model()
--------bayesian_ifr_model.pdf(250KB)
--------output()
--------rr_comorbidities_v6.stan(730B)
--------bibliography.bib(25KB)
--------bayesian_ifr_model.Rmd(46KB)
--------data()
--------.gitignore(6B)
--------ifr_with0.stan(993B)
--------rr_comorbidities_v5.stan(730B)
--------dev()
----ShinyApp()
--------Riskmodel.R(8KB)
--------preprocess_data.R(13KB)
--------Riskmodel_Alpha.R(7KB)
--------Shiny_Alpha.R(8KB)
--------app_dataset.csv(41KB)
--------Riskmodel.html(4.39MB)
--------Riskmodel.Rmd(20KB)
----Datasets_ingest.R(4KB)
----Study Summary Data()
--------China_Aging_Meta.xls(7KB)
--------CDC_Death_Comorbidity_Counts_Aug_30.csv(1.54MB)
--------1DS_Meta_Dataset.xls(76KB)
--------OpenSafely_Counts.xls(12KB)
--------China_ERJ.xls(9KB)
--------China_Hypertension.xls(7KB)
--------NYC_JAMA.xls(10KB)
--------1DS_Meta_Dataset_ww.xls(65KB)
--------NBER_IFR_Meta_Dataset.xls(46KB)
--------NYState_Fatality_Comorbidity.xls(10KB)
--------WW_additional_datasets.xlsx(1.16MB)
--------NBER_IFR_Meta_Dataset.xlsx(32KB)
----README.md(3KB)
----.gitignore(127B)
----RiskModel.Rproj(205B)