MACS:MACS-ChIP-Seq的基于模型的分析

时间:2024-05-22 09:10:09
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更新时间:2024-05-22 09:10:09

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MACS:ChIP-Seq的基于模型的分析 最新发布: Github: PyPI: Bioconda: Debian Med: 介绍 随着测序技术的改进,染色质免疫沉淀后再进行高通量测序(ChIP-Seq)成为研究全基因组蛋白质-DNA相互作用的工具。 为了解决缺乏有力的ChIP-SEQ分析方法中,我们提出ÇhIP-情商的M个基于Odel等-A nalysis(MACS),用于识别转录因子结合位点。 MACS捕获基因组复杂性的影响,以评估丰富的ChIP区域的重要性,而MACS通过结合测序标签位置和方向信息来提高结合位点的空间分辨率。 MACS可以轻松地单独用于ChIP-Seq数据,也可以与特异性增加的对照样品一起使用。 此外,作为一般的峰调用者,如果要问的问题很简单:MACS可以比随机背景找到显着的读数覆盖率,那么MACS也可以应用于任何“ DNA富集测定”。 请注意,当前的M


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