文件名称：PISCA
文件大小：101KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-07 18:25:24
Java
PISCA 使用体细胞染色体改变的系统发育推断。 BEAST 1.8.x的插件。 引文 如果您使用此软件，请引用： 如果您使用随机局部模型，请引用： 如果使用确定性偏差校正，请引用： 已知问题和局限性 警告：到目前为止，PISCA仅与BEAST的Java版本兼容，因此必须包含参数-beagle_off （或在GUI中取消选择BEAGLE）。 这使得PISCA的当前版本与BEAST v1.10.X不兼容。 警告： PISCA与BEAST中实现的大都会耦合MCMC算法兼容。 但是，BEAST v1.8.X中存在一个错误，该错误阻止插件使用MC3算法。 为了解决此问题，您可以下载并编译或使用随PISCA分发的类BeastMain.class修补BEAST v1.8.4 beast.jar（位于BEAST_ROOT / lib中）。补丁/BeastMain.class）
【文件预览】：
PISCA-master
----patch()
--------BeastMain.class(19KB)
----install.sh(6KB)
----src()
--------PISCA()
----examples()
--------rlc_test.xml(14KB)
--------validation.xml(14KB)
--------strict_test.xml(12KB)
----LICENSE(34KB)
----README.md(14KB)
----beast_sdk.properties.in(47B)
----build.xml(6KB)
----.gitignore(270B)