文件名称：VBEM:VBEM方法执行GRN推断
文件大小：10KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-30 09:44:34
MATLAB
VBEM 该存储库包含一些MATLAB脚本，这些脚本包含我的博士学位论文第4章中描述的AR1MA1-VBEM方法的核心算法，标题为： 从基因表达微阵列数据推断GRN和蛋白质谱的贝叶斯方法，2012，ISBN： 从基因表达时间序列数据执行基因调控网络（GRN）逆向工程。 基于一阶自回归（AR1）模型的早期VBEM方法发表于： 逆向工程基因调控网络的统计模型，2009，DOI： 当前版本通过引入一阶自回归一阶移动平均（AR1MA1）模型来改进以前的方法，该模型更适合数据的噪声性质。 我们正在将该方法的当前版本更新为（ i ）处理RNA-Seq和微阵列数据，以及（ ii ）通过友好的用户界面对其进行改进。 希望很快将在评级良好的期刊上发布新出版物。
【文件预览】：
VBEM-master
----CYTOSCAPE.m(2KB)
----VBEM-GNW()
--------VBE.m(381B)
--------HYPERPARAMETERS.m(4KB)
--------VBM.m(484B)
--------LOWERBOUND.m(822B)
----README.md(1KB)
----ASSETS()
--------GRN.vizmap.xml(9KB)
----FUNCTIONS()
--------VBE.m(371B)
--------HYPERPARAMETERS.m(4KB)
--------VBM.m(468B)
--------POSTERIOR.m(501B)
--------LOWERBOUND.m(821B)