文件名称:GPU MrBayes-开源
文件大小:12.18MB
文件格式:RAR
更新时间:2024-05-17 19:56:05
开源软件
GPU MrBayes使用CUDA在GPU上实现MrBayes MC(3)。 在您的文章中使用我们的程序时,请引用我们的论文“在多GPU上有效实施MrBayes”(http://mbe.oxfordjournals.org/content/early/2013/03/14/molbev.mst043.abstract.html ?papetoc)。
【文件预览】:
MrBayes-3.2.6-GPU-V1
----gpl.txt(35KB)
----bayes.c(48KB)
----best.h(2KB)
----mcmc.h(2KB)
----likelihood.h(6KB)
----mbbeagle.h(1KB)
----command.c(822KB)
----ChangeLog.txt(2KB)
----proposal.c(492KB)
----CompileInstructions_for_CUDA.txt(2KB)
----mbbeagle.c(44KB)
----._proposal.h(171B)
----utils.c(399KB)
----runchain.cpp(15KB)
----config.log(9KB)
----config.h(1KB)
----config.h.in(1KB)
----CompileInstructions_original.txt(7KB)
----utils.h(15KB)
----._mcmc.h(171B)
----datasets()
--------48X11949.protein.nex(588KB)
--------288x3386.dna.nex(959KB)
--------scalability-taxa-dataset5()
--------185X11195.dna.nex(2.01MB)
--------scalability-sites-protein()
--------codon.nex(2KB)
--------scalability-sites-DNA()
--------1255X13868.protein.nex(16.45MB)
--------replicase.nex(8KB)
--------1255X11540.protein.nex(13.94MB)
--------26x1546.dna.nex(40KB)
--------8X10088.protein.nex(101KB)
--------newExper()
--------1partition.nex(1.14MB)
----Makefile-origin(751B)
----configure(144KB)
----kernel.h(2KB)
----install-sh(5KB)
----Makefile.in(735B)
----config.status(27KB)
----bayes.h(99KB)
----configure.in(6KB)
----likelihood.c(332KB)
----sumpt.c(320KB)
----proposal.h(10KB)
----command.h(1KB)
----likelihood_original.c(332KB)
----model.h(2KB)
----sumpt.h(2KB)
----README.txt(4KB)
----mcmc.c(777KB)
----best.c(65KB)
----Makefile(2KB)
----kernel.cu(27KB)
----._bayes.h(171B)
----._sumpt.h(171B)
----._proposal.c(171B)
----mcmc_original.c(698KB)
----model.c(1.11MB)
----outline.cu(4KB)