ggdendroplot:为ggplot2绘制高度可修改的树状图

时间:2024-03-25 11:58:49
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文件名称:ggdendroplot:为ggplot2绘制高度可修改的树状图

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更新时间:2024-03-25 11:58:49

ggplot2 clusters cluster-analysis dendrograms dendrogram

ggdendroplot 一个包,可在中绘制高度可修改的树状图。 可以很容易地修改树状图并将其添加到现有的ggplot对象中。 ggdendroplot将data.frame或矩阵作为输入,其中要对列进行聚类(按行)。 然后,ggdendroplot使用R 的dist和hclust函数生成聚类矩阵和一个对象,其中包含有关分层聚类的数据。 然后使用ggplot2的geom_path图层对数据进行可视化处理。 安装 从git仓库安装ggdendroplot软件包: devtools :: install_github( " solatar/dendroplot " ) 默认树状图 加载软件包,在ggplot中创建第一个括号。 您可以通过clustmethod争论更改聚类算法(默认情况下为“ complete”,请检查“ hclust”以查看该方法还有哪些其他选项)。 library( g


【文件预览】:
ggdendroplot-master
----NAMESPACE(82B)
----readme_files()
--------dendro_down.png(4KB)
--------dendro_down_flipped.png(4KB)
--------dendro_custom.png(11KB)
--------dendro_left.png(4KB)
--------dendro_custom2.png(5KB)
--------dendro_up.png(4KB)
----DESCRIPTION(350B)
----R()
--------hello.R(450B)
--------geom_dendro.R(5KB)
----.Rproj.user()
--------366773DE()
--------shared()
----.Rbuildignore(28B)
----README.md(2KB)
----ggdendroplot.Rproj(356B)
----man()
--------hello.Rd(128B)
--------geom_dendro.Rd(2KB)

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