文件名称：ncov-wa-build:华盛顿SARS-CoV-2序列的Augur构建
文件大小：2.62MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-09 06:19:57
Python
关于 该库使用分析华盛顿州的病毒基因组。这是存储库的副本，该存储库已针对华盛顿特定的版本进行了修改。这些修改很大程度上取材于约翰·哈德斯顿（John Huddleston）在。 用法 克隆此存储库。 git clone https://github.com/blab/ncov-wa-build.git cd ncov-wa-build/ 根据需要在wa_profile/wa/builds.yaml修改构建定义。 如果在外部运行 从下载序列。您需要输入GISAID登录名。 登录到GISAID的EpiCoV网站 点击“下载”以弹出一个模态窗口 在此窗口中，单击“ nextmeta”以下载文件nextstrain_metadata.tsv.bz2。应该将其解压缩并保存为data / metadata.tsv。 然后，在此窗口中单击“ FASTA”以下载文件nextstrain_sequence