文件名称：GenomicsFeatures:基因组特征矩阵分析
文件大小：403KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-22 12:35:36
Python
#GenomicsFeatures ###基因组学特征矩阵分析 该项目包含一个用 Python 编写的 Google App Engine 应用程序，该应用程序执行以下任务： 将 tsv 格式的n x m特征矩阵转换为 csv 格式的文件，其中包含n x m行元组（特征、样本、值） - run_fmx_convert.py 在 Datastore 中为此数据构建模型 - model.py 运行一个仅限地图的 MapReduce 作业，将您从 GCS 转换的 csv 文件导入模型 - pipeline.py 也可以通过bulkload 机制导入数据，但速度很慢。 - run_upload_data.sh 在特征名称上定义和构建全文搜索索引。 - 搜索search.py 提供允许您执行以下操作的用户界面：- main.py 执行上面列出的大部分管理任务。 使用全文搜索查找特征。