文件名称:omoponfhir-main-dstu2:DSH2的FHIR上的OMOP
文件大小:425KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-25 05:58:30
Dockerfile
OMOPonFHIR实现版本1 支持OMOP v5.2 支持DSTU2 STU3:可从获得STU3 数据库依赖 此应用程序需要OMOP V5.2数据库才能工作。 请执行以下操作来设置数据库。 转到下载词汇表。 从获取v5.2 DDL 获取PostgreSQLDocker镜像:docker pull postgres 运行docker run --name omopv52 -p 5432:5432 -e POSTGRES_PASSWORD = -d postgres 创建数据库和架构 从ODHSI运行DDL 在fhir_names文件夹中为omoponfhir_v5.2_f_observation_view_ddl.txt和omoponfhir_v5.3_f_person_ddl.txt运行DDL。 加载从雅典娜下载的词汇表。 加载数据集(如果有)。 使用fhir_n
【文件预览】:
omoponfhir-main-dstu2-master
----.gitmodules(491B)
----pom.xml(1KB)
----Jenkinsfile(2KB)
----Dockerfile(622B)
----omoponfhir-dstu2-server()
----LICENSE(11KB)
----updateSubmodules.sh(181B)
----docker-compose.yml(145B)
----.gitignore(2KB)
----omoponfhir-omopv5-dstu2-mapping()
----fhir_names()
--------insert_names_to_f_person.sql(1KB)
--------names.dmp(3.69MB)
--------omoponfhir_v5.2_f_immunization_view_ddl.txt(3KB)
--------README.md(766B)
--------omoponfhir_v5.2_f_observation_view_ddl.txt(3KB)
--------omoponfhir_f_person_ddl.txt(506B)
----README.md(4KB)
----omoponfhir-omopv5-jpabase()
----.gitattributes(66B)