一种基于Voss映射下计算DNA序列3-周期特性的快速算法 (2014年)

时间:2024-05-13 07:29:09
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更新时间:2024-05-13 07:29:09

自然科学 论文

DNA序列信号频谱3-周期特性被认为是用来区分编码区和非编码区的一个重要特征,传统的DNA序列分析中频谱计算量大占用了大量计算时间,使得分析效率极低。为提高DNA序列分析效率,针对传统频谱计算量大的问题,从3-周期特性原理出发,推导出了一种基于Voss映射下快速计算DNA序列3-周期频谱的方法。该方法有效避开计算离散傅立叶变换(DFT),从序列本身直接得到信噪比。实验结果表明快速算法计算效率是DFT方法的百倍之上,极大减小基因的信噪比计算时间,提高DNA序列识别中信噪比的计算效率。


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