文件名称:bats
文件大小:3.81MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-19 18:34:11
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分析Hipposideros diadema , dinops和demissus RADseq数据的资料库 请参阅使用RADstackshelpR管道优化堆栈参数的过程: 请参阅过滤过程以除去旁系同源物和低质量的变体,并过滤缺失的数据以生成高质量的SNP数据集: 请参阅以下三个当前物种之间的遗传结构初步分析: 查看机器学习物种定界方法之间的比较,以确定我们数据集中实际存在的物种数量: 请参阅物种树分析,以重构我们使用SVDquartets,treemix和SNAPP确定的推定物种之间的关系:
【文件预览】:
bats-master
----.gitignore(40B)
----.Rproj.user()
--------7F59C811()
--------shared()
----optimize.denovo.R(3KB)
----README.md(1KB)
----bats.Rproj(205B)
----optimize.denovo.Rmd(1KB)
----investigate.structure.html(2.71MB)
----optimize.denovo.html(1.41MB)
----.Rhistory(391B)
----filter.rad.snps.Rmd(4KB)
----filter.rad.snps.html(2.87MB)
----investigate.structure.Rmd(9KB)