文件名称:DFT的matlab源代码-kcon:k-Bags卷积神经网络
文件大小:21.17MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-14 21:52:47
系统开源
DFT的matlab源代码康康 kCON是用于化学的可扩展且可转移的深度学习框架,能够从小型和废料训练集中深入了解化学计量比不同的原子结构。 作者:陈鑫 电子邮件: 1.相关工作 Chen,X.,Jørgensen,MS,Hammer,B.,&Li,J.(2017年)。 通过机器学习了解原子化学。 《自然通讯》,正在审查中。 2.要求 所有代码都是用Python3.6编写的。 一些代码可以在Python2.7.x下完美执行。 张量流> = 1.3 麻木 科学的 朱皮特 matplotlib scikit学习 酶> = 3.12 3.用法 请参阅使用此软件包的指南。 4.数据集 为了从github中提取这些数据集文件, 应该安装。 有一些内置的数据集,包括: QM7 GDB-9 萘20k 喹啉(PBE,DFTB) 锐钛矿型二氧化钛(DFTB) 有关如何构建这些数据集的更多详细信息,请参见指南。 有关如何从原始文件生成这些数据集的xyz文件的更多详细信息,请参见指南。 5.模块 该项目的组织方式与之下的其他项目一样。 模型 inference.py :有关kCON模型的详细实现。 kcnn
【文件预览】:
kcon-jctc
----kcnn()
--------constants.py(3KB)
--------predictor.py(10KB)
--------summary_utils.py(2KB)
--------test_transformer_forces.py(13KB)
--------amsgrad.py(7KB)
--------utils.py(8KB)
--------inference.py(19KB)
--------train.py(11KB)
--------evaluation.py(12KB)
--------predictor_examples.py(4KB)
--------build_dataset.py(6KB)
--------database.py(13KB)
--------pipeline.py(9KB)
--------distributed_train.py(3KB)
--------__init__.py(111B)
--------test_pipeline.py(4KB)
--------test_transformer.py(7KB)
--------.gitignore(106B)
--------save_model.py(8KB)
--------multi_gpu_train.py(18KB)
--------kcnn.py(29KB)
--------calculator.py(2KB)
--------transformer.py(61KB)
----Guide.md(4KB)
----__init__.py(111B)
----doc()
--------images()
--------theory.tex(1010B)
--------theory.pdf(1.19MB)
--------energy.tex(12KB)
--------forces.tex(10KB)
--------.gitignore(93B)
--------appendix.tex(31KB)
----.gitignore(1KB)
----test_files()
--------transform_forces.xyz(4KB)
----README.md(5KB)
----scripts()
--------gdb9.py(3KB)
--------Readme.md(56B)
--------qm7.py(2KB)
--------bx.py(5KB)
--------md_datasets.py(3KB)
----datasets()
--------LJ.xyz(10.81MB)
--------Bx-.xyz(134B)
--------TiO2.xyz(133B)
--------qm7.xyz(5.17MB)
--------ethanol10k.xyz(11.81MB)
--------gdb9.xyz(134B)
--------md3k.xyz(609KB)
--------naphthalene20k.xyz(133B)
--------C9H7Nv1.xyz(133B)
--------.gitignore(120B)
--------CNH_dft_unique.xyz(11.7MB)
--------qm7.mat(17.06MB)
--------.gitattributes(330B)