文件名称:PBPK-perc:模型文件
文件大小:16.13MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-22 02:12:51
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PBPK-perc在3 + CC-45小鼠小鼠中 该资料库包括PBPK建模,MC / MCMC模拟和提交给Tox.Sci的题为“雄性小鼠全氯乙烯毒代动力学中全人群组织和代谢物特异性变异的定量表征”的手稿结果的分析文件。 建模过程很复杂,包含不同的步骤和组件。 下图将有助于了解当前贝叶斯人口PBPK模型的整体情况。 PBPK建模阶段在以下软件上运行: 在德克萨斯州农工大学高性能研究中心的Terra集群中,在Linux / Unix环境下的MCSim v.5.6.5软件上运行了初步模型和最终模型的MCMC模拟。 全球敏感性分析是在我们实验室开发的“ pksensi” 1.2.0 R版程序包上运行的。 在Windows上的MCSim v.5.6.5软件上运行模型拟合的评估。 剂量指标预测是在Windows上的R下在MCSim上运行的。 工作流,描述建模过程的步骤及其输入和输出 参考
【文件预览】:
PBPK-perc-main
----GSA()
--------perc.f.58p.3strains.ci95.10k.4t.maxRank.csv(16KB)
--------perc.58.posterior.ci95.R(7KB)
--------GSA.perc.R(24KB)
--------perc.mouse.3strains.58p.mcmc.3.in(39KB)
--------perc.GSA.setpoint.f.58p.in(3KB)
--------perc.mouse.3strains.58p.mcmc.4.in(39KB)
--------perc.f.58p.3strains.ci95.10k.3t.maxRank.csv(11KB)
--------perc.mouse.3strains.58p.mcmc.1.in(39KB)
--------perc.mouse.3strains.58p.mcmc.random5000.out(13.52MB)
--------perc.58.param.prior.dist.R(8KB)
--------README.md(1KB)
--------perc.mouse.3strains.58p.mcmc.2.in(39KB)
--------Fig. S-1.1.jpg(563KB)
----Model Files()
--------perc.mouse.3strains.58p.mcmc.3.in(39KB)
--------perc.mouse.48strains.43p.mc.in(8KB)
--------perc.mouse.48strains.43p.mcmc.1.50L.test.out(136KB)
--------perc.mouse.48strains.43p.set.in(6KB)
--------perc.mouse.48strains.43p.mcmc.3.in(163KB)
--------perc.mouse.48strains.43p.mcmc.2.50L.test.out(136KB)
--------perc.mouse.48strain.27p.mcmc.2.in(162KB)
--------perc.mouse.3strains.58p.mcmc.4.in(39KB)
--------perc.mouse.48strains.43p.mcmc.3.50L.test.out(136KB)
--------perc.mouse.48strains.43p.mc.out(6.18MB)
--------perc.mouse.48strain.27p.mcmc.4.in(162KB)
--------perc.v3.4.model(95KB)
--------perc.mouse.3strains.58p.mcmc.1.in(39KB)
--------perc.mouse.mcmc.3strains.random5000.out(6.87MB)
--------perc.mouse.48strain.27p.mcmc.1.in(162KB)
--------perc.mouse.48strains.43p.mcmc.4.50L.test.out(136KB)
--------perc.mouse.48strains.43p.mcmc.4.in(163KB)
--------Figure 1.jpg(1.88MB)
--------perc.mouse.48strain.27p.mcmc.3.in(162KB)
--------perc.mouse.48strains.43p.mcmc.2.in(163KB)
--------perc.mouse.48strains.43p.mcmc.1.in(163KB)
--------README.md(1KB)
--------perc.mouse.3strains.58p.mcmc.2.in(39KB)
--------perc.mouse.48strains.43p.set.pop.CC-45.sum.out(30KB)
----Dosemetics()
--------Figure S2.png(51KB)
--------Comb.TKVF.met.csv(1KB)
--------TKVF99.comb.AUC.csv(4KB)
--------perc.48strains.model.R(97KB)
--------Dosimetry.R(63KB)
--------TKVF95.comb.AUC.csv(4KB)
--------README.md(959B)
--------perc.mouse.48strains.43p.met.set.in.R(5KB)
----README.md(1KB)
----Analysis_R()
--------LOD.v1.data(231B)
--------perc.Parameter.48.43p..mcmc.R(15KB)
--------CC45.csv(35KB)
--------Model_fitting.html(5.31MB)
--------Model_fitting.rmd(40KB)
--------README.md(2KB)
--------Convergence-MCMC.rmd(6KB)
----Data()
--------LOD.v1.data(231B)
--------CC45.csv(35KB)